Da ich mir einige Stunden um die Ohren schlagen mußte, um eine Lösung hierfür zu finden, hier eine kleine Anleitung, wie man mehrere Verzeichnisse sichern kann:
1) Einen neuen Freigabe-Ordner anlegen, z.B. Backups
2) Unterordner anlegen, die wie die zu sichernden Freigaben heißen
3) Per SSH...